De structuur van het koetswerk van C1 zorgt voor een uitstekende bescherming van de inzittenden:
- de blokken vooraan en achteraan bestaan uit langsdragers met geprogrammeerde kreukelzones;
- de vloergroep en de voorruitstijl werden speciaal bestudeerd om de energie te absorberen en naar de achterzijde van de auto af te leiden.
- de verstevigingsbalken in de deuren beschermen de passagiers bij zijdelingse aanrijdingen.

C1 kan over zes airbags beschikken voor een optimale bescherming van alle passagiers:
- twee frontale airbags (de passagiersairbag kan worden uitgeschakeld om vooraan een kinderzitje te kunnen plaatsen);
- twee laterale airbags die de thorax en de buik van de passagiers beschermen;
- twee gordijnairbags om het hoofd van de inzittenden vooraan en achteraan te beschermen.

C1 is voorzien van een bijzonder compleet remsysteem:
- twee geventileerde remschijven vooraan;
- een ABS (antiblokkeersysteem) dat de remdruk elektronisch regelt om te vermijden dat de wielen blokkeren;
- een elektronische remkrachtverdeler (EBD) die de remdruk tussen de wielen in evenwicht brengt;
- een CSC (stabiliteitscontrole in de bocht) die bij remming in de bocht de te volgen baan stabiliseert.

De achterbank (met 50/50 rugleuning) geniet van Isofix-bevestigingen met drie verankeringspunten, om in alle veiligheid kinderzitjes te installeren.